Wpływ jonów metali na strukturę rybozymu
Europejscy naukowcy badali strukturę katalitycznych molekuł RNA, skupiając się w szczególności na wpływie jonów metali na ich strukturę i funkcje.Rybozymy to molekuły RNA zdolne do katalizowania specyficznych reakcji biochemicznych w sposób podobny do enzymów białkowych. Odkrycie ludzkiego rybozymu CPEB3, związanego z wirusem zapalenia wątroby typu D, było olbrzymim przełomem i otworzyło przed badaczami nowe perspektywy.
Dwuwartościowe jony metali mają istotną strukturalną i/lub katalityczną rolę w funkcjonowaniu wielu białek oraz RNA, włączając w to prawidłowe fałdowanie. Brakuje jednak szczegółowych informacji na temat dokładnych mechanizmów działania jonów metali.
Zakres finansowanego przez UE projektu HUMANRIB (HumanRib: Metal ion binding - structure - function relations of the human CPEB3 ribozyme) objął wyjaśnienie mechanizmu działania i zbadanie zależności funkcji od struktury rybozymu CPEB3. Działalność badawcza objęła ocenę istotności jonów metali w rybozymach.
Aby wyjaśnić to zagadnienie, naukowcy uzyskali wysokorozdzielcze struktury NMR kilku części rybozymu CPEB3 i scharakteryzowali miejsca wiązania. Pozwoliło to określić strukturalne i termodynamiczne zmiany w obrębie rybozymu po dodaniu dwuwartościowych jonów Mg2+, naturalnego kofaktora CPEB3.
Wyniki badania wskazują, że do uzyskania ogólnego fałdowania rybozymu CPEB3 wystarcza obecność jonów jednowartościowych, lecz przyłączenie Mg2+ do paru miejsc jest wymagane, aby w pełni uformować miejsce aktywne i spójną strukturę natywną. Ponadto przewidywana struktura trzeciorzędowa formowała się w pełni tylko w obecności Mg2+.
Reasumując, odkrycia uczestników badania HUMANRIB wskazują na istotność jonów Mg2+ dla integralnej struktury rybozymu i jego funkcji katalitycznej. Oprócz podstawowej wiedzy dotyczącej tego nowego rodzaju molekuł RNA, wyniki te zapewniają informacje na temat ich tła ewolucyjnego.
Źródło: www.cordis.europa.eu
Dwuwartościowe jony metali mają istotną strukturalną i/lub katalityczną rolę w funkcjonowaniu wielu białek oraz RNA, włączając w to prawidłowe fałdowanie. Brakuje jednak szczegółowych informacji na temat dokładnych mechanizmów działania jonów metali.
Zakres finansowanego przez UE projektu HUMANRIB (HumanRib: Metal ion binding - structure - function relations of the human CPEB3 ribozyme) objął wyjaśnienie mechanizmu działania i zbadanie zależności funkcji od struktury rybozymu CPEB3. Działalność badawcza objęła ocenę istotności jonów metali w rybozymach.
Aby wyjaśnić to zagadnienie, naukowcy uzyskali wysokorozdzielcze struktury NMR kilku części rybozymu CPEB3 i scharakteryzowali miejsca wiązania. Pozwoliło to określić strukturalne i termodynamiczne zmiany w obrębie rybozymu po dodaniu dwuwartościowych jonów Mg2+, naturalnego kofaktora CPEB3.
Wyniki badania wskazują, że do uzyskania ogólnego fałdowania rybozymu CPEB3 wystarcza obecność jonów jednowartościowych, lecz przyłączenie Mg2+ do paru miejsc jest wymagane, aby w pełni uformować miejsce aktywne i spójną strukturę natywną. Ponadto przewidywana struktura trzeciorzędowa formowała się w pełni tylko w obecności Mg2+.
Reasumując, odkrycia uczestników badania HUMANRIB wskazują na istotność jonów Mg2+ dla integralnej struktury rybozymu i jego funkcji katalitycznej. Oprócz podstawowej wiedzy dotyczącej tego nowego rodzaju molekuł RNA, wyniki te zapewniają informacje na temat ich tła ewolucyjnego.
Źródło: www.cordis.europa.eu
Tagi: rybozym, struktura, molekula, rna, jon, metal
wstecz Podziel się ze znajomymi
03-03-2023
Najdokładniejsze systemy satelitarnego transferu czasu
Nie zawsze zegar atomowy działa lepiej niż kwarcowy.
03-03-2023
Ponad połowa chorych z SARS-CoV2 cierpi na długi covid
Przez długi czas może mieć takie objawy jak zmęczenie.
03-03-2023
Uniwersytet Warszawski będzie kształcić kadry dla energetyki jądrowej
Przekazał Wydział Fizyki UW.
Recenzje