Badanie numeryczne oddziaływań molekularnych w mózgu
W ramach jednego z europejskich projektów przeprowadzono badanie numeryczne, aby określić, w jakim stopniu manipulacja funkcjami neuroprzekaźników monoaminowych (MN) może posłużyć do leczenia chorób neurologicznych.
Układy monoaminergiczne (MS) są sieciami neuronów wykorzystującymi MN w celu regulacji ważnych procesów poznawczych. Neuroprzekaźniki monoaminowe to z kolei neuromodulatory zawierające grupę aminową i wywodzące się z aminokwasów aromatycznych, takich jak fenyloalanina, tyrozyna i tryptofan, a także z hormonów tarczycy.
Układy monoaminergiczne w mózgu odpowiadają za etiologię szeregu chorób neurodegeneracyjnych. Naukowcy uczestniczący w finansowanej ze środków unijnych inicjatywie COMPBAND (Computational studies of the biogenic amines of the brain for targeting neurological diseases) skoncentrowali się na dwóch aspektach MS. Pierwszym z nich był enzym znany pod nazwą monoaminooksydazy (MAO), który reguluje poziom amin w obszarze synaptycznym. Drugi to receptor histaminowy H2, który wiąże biogenną aminę – histaminę – jako swój podstawowy endogenny ligand.
Przeprowadzone w ramach projektu badania pomogły wyjaśnić precyzyjny mechanizm molekularny leżący u podstaw aktywności katalitycznej MAO i dowiodły skuteczności nowo opracowanego dwuetapowego mechanizmu przenoszenia wykorzystującego wodorki. W ujęciu szczegółowym wykazano, że oba izoenzymy MAO – A i B – działają w oparciu o ten sam mechanizm wodorkowy. Odkrycie to ma szczególne znaczenie dla opracowywania nowych cząsteczek docelowych w funkcji inhibitorów monoaminooksydazy.
Izoenzymy MAO A i B wykazują skrajnie różne powinowactwo względem podłoża i inną wrażliwość na działanie inhibitorów. Inhibitory MAO A mogą zwiększać stężenie serotoniny, co sprawia, że są pomocne w leczeniu depresji. Z kolei inhibitory MAO B redukują degradację dopaminy i zwiększają kontrolę nad funkcjami motorycznymi u pacjentów cierpiących na chorobę Parkinsona. Tym samym zdobyta dzięki projektowi wiedza może być cennym wsparciem w procesie racjonalnej modyfikacji monoaminooksydazy, dostarczając wskazówek umożliwiających projektowanie silniejszych i bardziej selektywnych inhibitorów MAO.
Uczestnicy projektu przeprowadzili badanie doświadczalne i numeryczne, monitorując skutki deuteracji powinowactwa receptora histaminowego H2 względem jednego antagonisty i trzech agonistów. Wywołane deuteracją zmiany w obrębie długości i siły wiązań wodorowych nie wpłynęły w znaczący sposób na wiązanie z antagonistą, natomiast zmieniły powinowactwo wszystkich agonistów. Badanie numeryczne obejmowało budowę modelu homologicznego receptora H2 oraz modelowanie kwantowo-chemiczne energii swobodnej wiązań z empirycznym kwantowaniem ruchu protonów. Przewidywany ogół wiązań histaminy i jej poddanego deuteracji analogu wykazał zgodność z wartościami liczbowymi uzyskanymi w drodze doświadczeń.
Podsumowując, przeprowadzona w ramach projektu analiza może posłużyć do opracowywania strategii zapobiegania neurodegeneracji oraz jej leczenia. W szczególności wesprze ona budowę całościowego kinetycznego modelu molekularnego procesu neurodegeneracji.
wstecz Podziel się ze znajomymi
Najdokładniejsze systemy satelitarnego transferu czasu
Nie zawsze zegar atomowy działa lepiej niż kwarcowy.
Ponad połowa chorych z SARS-CoV2 cierpi na długi covid
Przez długi czas może mieć takie objawy jak zmęczenie.
Uniwersytet Warszawski będzie kształcić kadry dla energetyki jądrowej
Przekazał Wydział Fizyki UW.
Recenzje